Utvalget konkluderte med kritikk både av måten ordningen ble administrert på og manglende tilsyn og kontroll, samt at pensjonsordningen mangler tilstrekkelig kompetanse og robusthet. Det ble fremsatt en rekke anbefalinger til fremtidige tiltak.

I påvente av utredningen utsatte styret behandlingen av alle enkeltsaker. Disse sakene ble senere overført til Statens pensjonskasse.

Som konsekvens av kritikken fra "Kjønstad-utvalget" ble § 10 i lov om pensjon for stortingsrepresentanter endret slik at ansvaret for å administrere pensjonsordningen ble overført fra pensjonsstyret til Statens pensjonskasse. Overføringen ble vedtatt ved lov av 6. mars 2009, jf. Innst. O. nr. 38 (2008–2009).

Ordlyden i lovens § 10 ble endret til følgende:

"Pensjonsordningen administreres av Statens pensjonskasse med unntak av saker om ventegodtgjørelse i henhold til § 7 som behandles av Stortingets presidentskap.

Pensjonskassen legger senest 1/2 år etter regnskapsårets slutt fram en beretning om virksomheten i siste regnskapsår. Beretningen blir gjennom vedkommende departement å forelegge Stortinget."

Ytterligere endringer i lov om pensjonsordning for stortingsrepresentanter er behandlet og vedtatt, jf. Innst. O. nr. 128 (2008–2009).